Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDE6HQ13956 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDE6HQ13956 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms