Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF2H2Q13888 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms