Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKP1Q13835 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
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PKP1Q13835 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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