Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RIN1Q13671 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RIN1Q13671 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms