Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL3Q13618 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL3Q13618 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL3Q13618 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms