Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNX1Q13596 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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