Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
TUBB3Q13509 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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TUBB3Q13509 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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TUBB3Q13509 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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TUBB3Q13509 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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TUBB3Q13509 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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TUBB3Q13509 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TUBB3Q13509 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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