Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LSAMPQ13449 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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