Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MSLNQ13421 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms