Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KLF1Q13351 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KLF1Q13351 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KLF1Q13351 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KLF1Q13351 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KLF1Q13351 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KLF1Q13351 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KLF1Q13351 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KLF1Q13351 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KLF1Q13351 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KLF1Q13351 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.2 ms