Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NME3Q13232 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NME3Q13232 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NME3Q13232 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NME3Q13232 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NME3Q13232 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NME3Q13232 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NME3Q13232 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NME3Q13232 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NME3Q13232 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NME3Q13232 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NME3Q13232 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NME3Q13232 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NME3Q13232 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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NME3Q13232 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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NME3Q13232 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NME3Q13232 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NME3Q13232 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NME3Q13232 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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