Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms