Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSTF3Q12996 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CSTF3Q12996 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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