Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
HOXC5Q00444 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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