Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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ERVPABLB-1P60509 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERVPABLB-1P60509 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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