Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMPOP42166 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMPOP42166 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TMPOP42166 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMPOP42166 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMPOP42166 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 551.3 ms