Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VPREB1P12018 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VPREB1P12018 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms