Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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