Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAPPC9Q96Q05 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms