Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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ZBED3Q96IU2 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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