Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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