Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TPRNQ4KMQ1 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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