Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.32□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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