| PTPN21 | Q16825 | RNU6-60P-201 | ENST00000364792 | 103 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1292P-201 | ENST00000383856 | 107 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA1-201 | ENST00000384107 | 130 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORD28B-201 | ENST00000390993 | 75 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA40.5-201 | ENST00000391061 | 128 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1135P-201 | ENST00000411083 | 103 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU5E-9P-201 | ENST00000411164 | 104 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-938P-201 | ENST00000411285 | 103 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | MIR6734-201 | ENST00000621166 | 68 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | 7SK.13-201 | ENST00000622040 | 250 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CXADR-202 | ENST00000356275 | 270 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.241-201 | ENST00000364470 | 117 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP61-201 | ENST00000516453 | 100 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL096861.1-201 | ENST00000610899 | 123 nt | BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | UBE3A-225 | ENST00000636667 | 5726 nt | TSL 5 BASIC | 1.7 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA25.7-201 | ENST00000364375 | 127 nt | BASIC | 1.69 | □□□□□ -2.14 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | RNU6-970P-201 | ENST00000516312 | 107 nt | BASIC | 1.69 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC107958.3-201 | ENST00000553410 | 431 nt | TSL 3 BASIC | 1.69 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CYP3A52P-201 | ENST00000563326 | 91 nt | BASIC | 1.69 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR3129-201 | ENST00000581095 | 76 nt | BASIC | 1.69 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC008133.2-201 | ENST00000624540 | 351 nt | BASIC | 1.69 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LINC01359-207 | ENST00000634799 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 1.69 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.150-201 | ENST00000363562 | 102 nt | BASIC | 1.68 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA67.6-201 | ENST00000391093 | 99 nt | BASIC | 1.68 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RPS26P48-201 | ENST00000491713 | 339 nt | BASIC | 1.68 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC074198.2-201 | ENST00000508153 | 258 nt | BASIC | 1.68 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU7-121P-201 | ENST00000516604 | 62 nt | BASIC | 1.68 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORD36C-201 | ENST00000516733 | 66 nt | BASIC | 1.68 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR4421-201 | ENST00000578133 | 69 nt | BASIC | 1.68 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL157834.3-201 | ENST00000615543 | 103 nt | BASIC | 1.68 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CTDSPL2-202 | ENST00000558373 | 4255 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.68 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP48-201 | ENST00000363969 | 126 nt | BASIC | 1.67 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | PCNPP3-201 | ENST00000393579 | 471 nt | BASIC | 1.67 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP127-201 | ENST00000411051 | 133 nt | BASIC | 1.67 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1054P-201 | ENST00000411293 | 104 nt | BASIC | 1.67 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU7-41P-201 | ENST00000515917 | 61 nt | BASIC | 1.67 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU1-92P-201 | ENST00000517017 | 135 nt | BASIC | 1.67 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR3646-201 | ENST00000578301 | 84 nt | BASIC | 1.67 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR3192-201 | ENST00000584920 | 77 nt | BASIC | 1.67 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ZNF732-201 | ENST00000419098 | 2193 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ZNF209P-201 | ENST00000593450 | 2304 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.272-201 | ENST00000364696 | 102 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORD114-22-201 | ENST00000365423 | 72 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA70.7-201 | ENST00000384159 | 133 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA27-201 | ENST00000384323 | 126 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR624-201 | ENST00000385217 | 97 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL133373.1-201 | ENST00000497098 | 94 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA18.4-201 | ENST00000516440 | 124 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC090821.2-201 | ENST00000523552 | 176 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR8065-201 | ENST00000620577 | 100 nt | BASIC | 1.66 | □□□□□ -2.14 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AP003174.1-201 | ENST00000306533 | 376 nt | TSL 2 BASIC | 1.65 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA24-201 | ENST00000384096 | 131 nt | BASIC | 1.65 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA51.10-201 | ENST00000384418 | 136 nt | BASIC | 1.65 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-768P-201 | ENST00000384683 | 107 nt | BASIC | 1.65 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR5197-201 | ENST00000583721 | 112 nt | BASIC | 1.65 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | DNAJC19P2-201 | ENST00000593340 | 302 nt | BASIC | 1.65 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR4791-201 | ENST00000607666 | 84 nt | BASIC | 1.65 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR4251-201 | ENST00000635819 | 61 nt | BASIC | 1.65 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ANGPTL3-201 | ENST00000371129 | 2805 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.64 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.180-201 | ENST00000363867 | 113 nt | BASIC | 1.64 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.440-201 | ENST00000384120 | 114 nt | BASIC | 1.64 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.494-201 | ENST00000384432 | 111 nt | BASIC | 1.64 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR517C-201 | ENST00000385103 | 95 nt | BASIC | 1.64 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL365434.1-201 | ENST00000412362 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 1.64 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC023790.1-201 | ENST00000482174 | 347 nt | BASIC | 1.64 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC087277.2-201 | ENST00000533203 | 151 nt | TSL 5 BASIC | 1.64 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC243994.1-201 | ENST00000618627 | 109 nt | BASIC | 1.64 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA75.5-201 | ENST00000391291 | 81 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-394P-201 | ENST00000410735 | 107 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC245047.7-201 | ENST00000440265 | 293 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RPS29P29-201 | ENST00000456396 | 171 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU7-96P-201 | ENST00000459535 | 64 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RPS29P24-201 | ENST00000486345 | 171 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR6844-201 | ENST00000637122 | 62 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | GNPDA2-204 | ENST00000509756 | 5382 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR570-201 | ENST00000384917 | 97 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.580-201 | ENST00000391004 | 95 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU1-98P-201 | ENST00000458992 | 160 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA31.24-201 | ENST00000517232 | 57 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL353770.2-201 | ENST00000620024 | 78 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC091895.1-201 | ENST00000624494 | 256 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CENPQ-201 | ENST00000335783 | 1733 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORD114-26-201 | ENST00000363543 | 72 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL354695.1-201 | ENST00000427935 | 228 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |