Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPN21Q16825 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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