Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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