Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

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Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ZFHX3Q15911 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZFHX3Q15911 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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