Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ATP6AP1Q15904 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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