Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USF2Q15853 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
USF2Q15853 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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