Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CCDC85BQ15834 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC85BQ15834 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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