Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SEC23AQ15436 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SEC23AQ15436 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SEC23AQ15436 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SEC23AQ15436 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SEC23AQ15436 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SEC23AQ15436 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SEC23AQ15436 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23AQ15436 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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