Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NECTIN1Q15223 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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