Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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