Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMCO1Q147U7 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMCO1Q147U7 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
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