Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NEDD9Q14511 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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