Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SCARF1Q14162 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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