Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms