Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNTB1Q13884 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNTB1Q13884 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.7 ms