Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TNFAIP1Q13829 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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