Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ATP1A4Q13733 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP1A4Q13733 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.6 ms