Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.8 ms