Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
XRCC4Q13426 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
XRCC4Q13426 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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