Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SP140Q13342 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SP140Q13342 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SP140Q13342 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SP140Q13342 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SP140Q13342 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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SP140Q13342 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SP140Q13342 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SP140Q13342 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SP140Q13342 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SP140Q13342 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SP140Q13342 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SP140Q13342 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SP140Q13342 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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SP140Q13342 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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SP140Q13342 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SP140Q13342 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SP140Q13342 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SP140Q13342 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SP140Q13342 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SP140Q13342 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SP140Q13342 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SP140Q13342 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SP140Q13342 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SP140Q13342 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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SP140Q13342 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SP140Q13342 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SP140Q13342 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SP140Q13342 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SP140Q13342 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SP140Q13342 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SP140Q13342 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SP140Q13342 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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