Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1AQ13111 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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