Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EFEMP1Q12805 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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EFEMP1Q12805 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
EFEMP1Q12805 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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