Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGGTBP53611 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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