Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ERFP50548 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ERFP50548 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ERFP50548 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms