Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CLDN4O14493 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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