Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SH3BP4Q9P0V3 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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