Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BSDC1Q9NW68 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BSDC1Q9NW68 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms