Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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LTBP3Q9NS15 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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LTBP3Q9NS15 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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LTBP3Q9NS15 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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LTBP3Q9NS15 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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LTBP3Q9NS15 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LTBP3Q9NS15 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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LTBP3Q9NS15 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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